微生物有机肥的生产使用粉碎机设备双级破碎机工作时在双电机的带动下，互相串连的两套转子同时高速旋转，物料在机内腔经上级转子击碎立即被飞速旋转的下级转子的锤头再次细碎，内腔物料相互飞撞，相互粉碎，达到锤粉料，料粉料的效果，形成了出料粒度小于2毫米的煤渣颗粒。双级粉碎机主要是运用冲击碰撞原理，落下物料被高速旋转的锤头冲击到齿型破碎板，由于破碎板是渐开线形齿板设计，物料碰撞破碎板的入射角接近90°，这种垂直碰撞是物料破碎方式，可实现脆性物料晶界间分离细碎。由于破碎板是多个齿型组成破碎腔，物料在腔内被锤头冲击多次反弹，物料落到齿型号间隙时，是定径破碎，控制物料粒度。锤头与破碎板齿尖间隙为出料粒度的1.5倍。排料口不设置筛板，所以没有堵塞现象。物料在破碎腔内滞留时间短。减少部件磨损，能耗低寿命长。
微生物的成本应该由三部分组成：有效功能菌、载体和其他添加物菌固然是成本的首要因素，否则就不是菌肥了。但目前菌、功能菌、活菌、基础菌、总菌数、菌落数、根际细菌，五花八门的叫法很多，定义不同，意义就不同，随意抓片树叶就含菌几万，不能说这含菌的树叶就值多少钱。各种定义的菌差异很大，确切的概念应该是有效功能菌。其次不同的菌种，功能、效果不同，成本也会有很大差异。
由于杂草会与庄稼争营养、水分和空间，于是有人发明了除草剂而生生灭活。这样做，虽然暂时控制了杂草，但也促进了杂草进化，变得更难对付。更糟糕的是，除草剂也消灭了土壤中的有益微生物，一些原本具有固氮能力的固氮菌，乃至将多余氮素还原为大气中的氮气的反硝化细菌也遭到了伤害。没有杂草呵护，农田变成光板地，雨季非常容易造成水土流失。
土壤中有益微生物，尤其那些固氮、解钾、解磷的微生物被消灭后，缺乏的养分单纯依靠使用氮、磷、钾为主的化肥补充，这加重了土壤酸化。土壤酸化后，原本存在的一些重金属物质溶解出来，再加上饲料、农药、化肥中重金属，使得重金属进入食物链。一些重金属本身具有致癌作用，进入人体后很难排出体外。自有化肥工业以来，作物产量大幅度提升了，然而连年持续高频率使用化肥，造成了土地板结、土壤酸化、食物质量下降。很多有益元素已严重低于历史的最好水平。比如钙质，根据我们的研究，用化肥生产出来的小麦面粉，比用有机农业模式生产的面粉缺钙76%，其余蔬菜、水果缺钙现象也是非常普通的。
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